西湖大学医学院郭天南教授及其合作团队,通过整合来自多家科研机构的数据,利用近 3000 份人体组织样本,完成了对 58 种正常组织和 25 种癌症类型的蛋白质进行深度分析。此次研究对象涵盖了超过 1.3 万种蛋白质,并成功构建了迄今为止分辨率最高、覆盖最广的人体蛋白质空间分布图谱。
蛋白质作为生命活动的主要执行者,同时也是大多数药物的靶点,然而,科学界长期以来缺乏对其在人体内整体空间分布的系统性认识。郭天南团队自主研发了一套微量样本蛋白质组分析技术,该技术能够仅使用芝麻大小的组织样本,即可进行标准化的蛋白质组学分析。
这项新技术不仅将蛋白质组学分析的速度提升了约十倍,还大幅降低了实验成本,为未来大规模、高通量的蛋白质组学研究奠定了坚实的技术基础。通过持续的样本收集和实验分析,研究团队建立了一个包含 15332 种蛋白质的数据库,并在此基础上对 13609 种蛋白质进行了精确的定量分析,最终绘制出这份高精度的“人体蛋白质组图”。
借助这份蛋白质“地图”,研究团队深入比较了 25 种癌症类型中肿瘤组织与癌旁组织的蛋白质表达差异,共发现了 8940 个差异表达蛋白。研究结果表明,不同癌症类型的蛋白质表达变化幅度存在显著差异,其中结肠癌、直肠癌和睾丸癌组织的蛋白质变化尤为突出。
此外,研究团队还鉴定出 2879 个肿瘤特异性蛋白,这些蛋白仅在特定的癌症类型中表现出表达变化。
该项重要研究成果以“Spatial distribution of the proteome in the human body and in cancers”为题,已发表在《自然》杂志上。目前,所有研究数据已通过公开数据库 db.prottalks.com 向全球研究者开放,允许用户查询蛋白质在 58 种人体组织中的丰度表达,并可对比不同癌症中的蛋白质变化情况。
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